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Son passage à la mairie se marque par un certains nombres d’actions fortes :
- la suppression de l’'octroi, le 25 novembre 1900, dont les recettes sont remplacées par des taxes directes ;
- des mesures de luttes antialcooliques, comme la réduction du nombre de cabarets ;
- la mise en place de régies pour le pavage des rues ;
- la mise en place d’un service municipal d’inhumation ;
  la création de la première ambulance municipale.

Il esquisse aussi un projet de réunion des communes suburbaines à Lyon (Villeurbanne, Bron, Vénissieux, Saint Fons).

Mais cette idée de 1903 rencontre l’opposition des communes concernées et la méfiance de beaucoup de Lyonnais envers

une banlieue trop « rouge ».

En 1904, il est réélu.

Il est nommé gouverneur de Madagascar, en 1905, et remplacé dans ses fonctions municipales par le jeune Edouard Herriot.

Quand il en revient et se présente comme candidat aux élections municipales de 1910, il perd : le successeur - Edouard Herriot -

qu’il avait implicitement désigné, est en place…

Il est élu député cette même année. A diverses reprises, il occupe des postes ministériels jusqu’en 1914.

Battu aux élections de 1919, Augagneur est nommé en 1920 gouverneur de l’'AEF (Afrique Equatoriale Française).

Opérations d’'urbanisme réalisées durant son mandat